Der Lehrstuhl für Bioinformatik befasst sich seit langem mit der Untersuchung von
Stoffwechselwegen in Pflanzen, sogenannten Pathways, mit Hilfe des Computers.
Eines der angestrebten Ziele ist beispielsweise, durch die Untersuchung von Pathways verschiedener
Pflanzen, Methoden zu identifizieren, welche es diesen Pflanzen erlaubt, mehr CO2 aufzunehmen als
anderen.
Im Rahmen des Projektes „Klimafreundliche Pflanzen“ versuchen die Forscher, C3-Pflanzen so
umzuprogrammieren, dass die Bindung von Sauerstoff an RuBisCo reduziert wird und folglich mehr CO2 in
den Pflanzenzellen umgesetzt wird. Dies kann erreicht werden, indem man die involvierten
Stoffwechselwege in der Pflanze künstlich am Computer nachbaut, anschließend optimiert und letztendlich
in lebende Pflanzenzellen überführt. Innerhalb dieses Projektes konnten bereits mehrere synthetische
Modelle optimiert und veröffentlicht werden.
In einem aktuellen Projekt prüfen die Forscher der Bioinformatik Transkriptomdaten, um herauszufinden,
wie sich die
metabolischen Flüsse in Modellpflanzen, wie zum Beispiel Arabidopsis thaliana, aber auch bei Algen und
Bäumen ändern, wenn die CO2-Konzentration er Atmosphäre steigt.
Bei weiterem Interesse lohnt es sich, den spannenden Fernsehbeitrag von 3sat anzuschauen, welcher
über
die Arbeit des Lehrstuhls für Bioinformatik an den Klimapflanzen berichtet.
Ebenfalls zu empfehlen, sind die Publikationen von Osmanoglu
et al.
(2021) und Naseem
et al. (2020) zum
Thema Klimapflanzen.
Osmanoglu,
O., Khaled AlSeiari, M., AlKhoori, H. A., Shams, S., Bencurova, E., Dandekar, T., & Naseem,
M. (2021). Topological Analysis of the Carbon-Concentrating CETCH Cycle and a Photorespiratory
Bypass
Reveals Boosted CO(2)-Sequestration by Plants. Front Bioeng Biotechnol, 9, 708417.
Naseem, M., Osmanoglu, O., & Dandekar, T. (2020). Synthetic Rewiring of Plant
CO(2)
Sequestration Galvanizes Plant Biomass Production. Trends Biotechnol, 38(4), 354-359.